ヨイカナさんに教えていただいて、副業の再設定をしたところ、正常な状態に戻りました。
それでついでに何度か装備を持ち替えて調べてみたのですが、
副業の料金リストは現在装備している本ではなく、直前に料金設定された方が優先して表示されるようです。
また、精錬と属性付与は対になっているらしく、片方の料金を設定すると、もう片方の料金設定がリセットされるようです。

つまり、今回の場合、私が本を持ち替えた後、料金を再設定し忘れたために起こったことだと思われます。
試しに今回の逆パターン（精錬本装備→精錬料金設定→属性本装備）をしたところ、
副業料金リストでは精錬受付中となり、コマンドにはどちらも表示されず、IDリストでは属性、精錬とも副業を行っているようには表示されませんでした。

片方の料金を設定すると、もう片方の料金設定がリセットされるというのは、おそらく現在の仕様かと思われますので、装備を取り替えた際は、忘れずに料金設定を行いましょうということですかね（＾＾；
氷雪さんにも、ヨイカナさんにも、私の不注意により余計なお手間を取らせてしまって申し訳ないです。